Poskestren Nurul Qarnain istiqamah memberikan layanan kesehatan pada santri dan masyarakat umum. Terdapat Nakes yang visit setiap harinya, sehingga santri dapat periksa. Dilengkapi juga dengan Toko Obat yang menyediakan berbagai macam obat dan vitamin, serta cek kesehatan meliputi cek kadar asam urat, kolesterol dan gula darah.